Výzkumný a zkušební letecký ústav je vnitřně členěn na část administrativní a část produktivních útvarů. Administrativa zahrnuje vedení společnosti a útvary služeb. Produktivní útvary jsou tvořeny relativně samostatnými jednotkami, které provádějí výzkumné, vývojové a zkušební aktivity. Celkem ve VZLÚ pracuje cca 320 zaměstnanců.
Kromě rozsáhlého areálu v Praze-Letňanech využívá VZLÚ pro své činnosti také detašované pracoviště s aerodynamickými tunely vysokých rychlostí v pražské části Palmovka.
Generální ředitel: Ing. Josef Kašpar
Technický ředitel: Ing. Viktor Kučera